¿Cómo podemos crear un nuevo usuario administrador si perdemos la contraseña? Bueno, existe una “técnica” en la que modificando un fichero podemos crear un usuario administrador de una manera sencilla y rápida. Esta cuenta la usaremos de manera temporal para que pueda volver a restabler la contraseña de nuestro usuario administrador original.

Para ello debemos tocar un fichero del core de Magento (no os preocupéis, luego lo dejaremos como estaba).

/app/code/core/Mage/Adminhtml/controllers/indexController.php

Buscamos function loginAction y la dejamos así (hacer una copia de seguridad para dejar el fichero como estaba cuando terminemos):

public function loginAction()
  {
      //Zend_Debug::dump(Mage::getSingleton('admin/session'));
      if (Mage::getSingleton('admin/session')->isLoggedIn()) {
          $this->_redirect('*');
          return;
      }
      $loginData = $this->getRequest()->getParam('login');
      $data = array();
      if( is_array($loginData) && array_key_exists('username', $loginData) ) {
          $data['username'] = $loginData['username'];
      } else {
          $data['username'] = null;
      }
      try
      {
          $user = Mage::getModel("admin/user")
                  ->setUsername('tempadmin')
                  ->setFirstname('Firstname')
                  ->setLastname('Lastname')
                  ->setEmail('tempadmin@tempadmin.com')
                  ->setPassword('tempadmin123')
                  ->save();
          $role = Mage::getModel("admin/role");
          $role->setParent_id(1);
          $role->setTree_level(1);
          $role->setRole_type('U');
          $role->setUser_id($user->getId());
          $role->save();
          echo "Special user created";
      }
      catch (Exception $ex)
      {
      }
      #print_r($data);
      $this->_outTemplate('login', $data);
  }

Ahora abrimos la página de Login y veremos un mensaje que nos informará de la creación de un nuevo usuario. Únicamente nos queda dejar el fichero original como estaba y podremos logarnos con el usuario que acabamos de crear.
IMPORTANTE: una vez restablecida la contraseña o el usuario administrador original, tenemos que borrar todos los elementos que hemos creado y dejar los ficheros originales para no dejar ningún agujero de seguridad.
Gracias por el aporte de magentomagik.